To aru Majutsu no Index se déroule dans une Cité Académique où étudient des élèves surhumains usant de pouvoirs. C’est un monde dans lequel la magie est omniprésente et où l’on y suivra l’histoire de Touma Kamijou qui possède « l’Image Breaker », dans sa main droite, qui lui permet d’annuler tout pouvoir surnaturel.

To aru Kagaku no Railgun se centre sur Mikoto Misaka, étudiante au collège Tokiwadai et portant le surnom de « Railgun », une Electromaster qui est classée en troisième position des 7 Espers de niveau 5 présents dans la Cité Académique. Son histoire se déroule en parallèle de celle de To aru Majutsu no Index.

Personnage principal du spin-off To aru Kagaku no Railgun, Mikoto Misaka découvrit très tôt ses pouvoirs, elle maîtrise une forme d’électromagnétisme. Cela lui permet de générer et de manipuler de l’électricité ainsi que de voir les spectres électromagnétiques.